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既然已在所得稅法中明定課徵法源依據，大法官第650號解釋自然停止適用，而營所稅查核準則第36條之1規定也沒有存在必要，在民國98年9月14日刪除了這條規定。

在大法官釋字第650號公布的97年10月31日至所得稅法修正生效的98年5月29日間，基隆公司若有將資金貸與股東或任何他人而未收取利息者，稅捐機關將沒有法源依據可以設算利息收入，此段期間將成為課稅的空窗期。